Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Lpin1-201ENSMUST00000067124 5581 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou4f1P17208 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms