Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

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Length 679 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gpm6b-205ENSMUST00000112227 3294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fv4P11370 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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