Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
SrfQ9JM73 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Ssxb9-201ENSMUST00000115584 879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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