Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Ifne-201ENSMUST00000056014 664 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Papss1-206ENSMUST00000200527 2811 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tlr5Q9JLF7 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms