Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 4933414I15Rik-201ENSMUST00000109123 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Nop56Q9D6Z1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Edil3-201ENSMUST00000043111 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm16348-202ENSMUST00000146654 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nop56Q9D6Z1 Csf2rb2-201ENSMUST00000096356 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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