Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Nkiras1-202ENSMUST00000132374 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gsdme-203ENSMUST00000165099 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Dspp-201ENSMUST00000112771 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm53-204ENSMUST00000150490 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Gm9978-201ENSMUST00000069431 3273 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 AU040320-203ENSMUST00000102608 4073 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Cd247-206ENSMUST00000161971 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Pacsin3Q99JB8 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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