Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm39091-201ENSMUST00000206189 553 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm19121-201ENSMUST00000215720 1022 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 AC156016.4-201ENSMUST00000227470 647 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm43737-201ENSMUST00000199915 2740 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm45076-201ENSMUST00000207517 1517 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms