Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ccser1Q8C0C4 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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