Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Vmn2r-ps125-201ENSMUST00000176234 931 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm22669-201ENSMUST00000158723 318 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Hormad2-202ENSMUST00000109948 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Klf10-203ENSMUST00000227920 2144 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Znrf3Q5SSZ7 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms