Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Usp30Q3UN04 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms