Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm17815-201ENSMUST00000198305 895 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 9230114K14Rik-202ENSMUST00000198720 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm13197-201ENSMUST00000117204 225 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm6276-201ENSMUST00000120159 579 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 1700019D03Rik-206ENSMUST00000190831 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Vmn1r199-201ENSMUST00000091732 1104 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Siah1bQ06985 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms