Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm15777-201ENSMUST00000123463 876 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 6330549D23Rik-202ENSMUST00000159536 1102 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm42591-201ENSMUST00000197249 700 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm43110-201ENSMUST00000198877 226 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm2981-201ENSMUST00000213947 694 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm19045-201ENSMUST00000222488 1193 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 CT030664.1-201ENSMUST00000223639 908 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm43340-201ENSMUST00000200448 1344 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Stard4-202ENSMUST00000118990 648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Vpreb3-202ENSMUST00000121151 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm8391-201ENSMUST00000185632 726 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 1700084F23Rik-201ENSMUST00000186662 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm35696-202ENSMUST00000220364 778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm5788-201ENSMUST00000220499 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 AC124173.1-201ENSMUST00000223701 189 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm36638-202ENSMUST00000192073 2169 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 1700030A11Rik-201ENSMUST00000125317 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 4933428C19Rik-201ENSMUST00000146043 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 E130114P18Rik-209ENSMUST00000186369 306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Igkv3-11-201ENSMUST00000197500 385 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm32591-201ENSMUST00000203038 414 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 AC118476.4-201ENSMUST00000215385 790 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 AC068459.1-201ENSMUST00000222492 905 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm14856-201ENSMUST00000121548 613 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm15788-202ENSMUST00000140087 751 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm37622-201ENSMUST00000192162 285 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm37218-201ENSMUST00000192917 390 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm33858-201ENSMUST00000216918 1411 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2bQ01097 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Grin2bQ01097 Gm19173-201ENSMUST00000204494 1523 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms