Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm14735-201ENSMUST00000121772 3088 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Ctnnd1-206ENSMUST00000111675 5089 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Cfap74-204ENSMUST00000123952 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Zbtb43-201ENSMUST00000028125 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Use1-203ENSMUST00000110054 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Rps29P62274 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms