Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Olfr709-ps1-201ENSMUST00000072368 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Col4a5-201ENSMUST00000112930 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Rpl28P41105 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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