Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm27913-201ENSMUST00000184473 173 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm37113-201ENSMUST00000195675 1157 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Cdk2ap1-205ENSMUST00000196910 483 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm32921-201ENSMUST00000200592 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm5737-201ENSMUST00000208668 1272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 AC167202.2-201ENSMUST00000220155 296 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm18616-201ENSMUST00000222898 1400 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Olfr1415-201ENSMUST00000071521 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Prune2-202ENSMUST00000223920 1803 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm4405-201ENSMUST00000106038 982 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm7158-201ENSMUST00000120079 903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm24298-201ENSMUST00000158299 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm5499-201ENSMUST00000090731 885 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Folr2-201ENSMUST00000094141 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Srsf7-201ENSMUST00000063417 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm39312-201ENSMUST00000213586 2195 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Fmo4-201ENSMUST00000028014 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Efcab12-203ENSMUST00000184428 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Sept11-207ENSMUST00000202217 1380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Ighv1-67-201ENSMUST00000103538 294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Ighv1-72-201ENSMUST00000103541 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 1700049E15Rik-202ENSMUST00000152737 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Mir1964-201ENSMUST00000158514 83 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Ear6-202ENSMUST00000169070 893 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm25736-201ENSMUST00000175165 101 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm9553-201ENSMUST00000185703 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Olfr1264-201ENSMUST00000099758 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Chd1P40201 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm20406-201ENSMUST00000173993 423 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm27283-201ENSMUST00000184853 323 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm3176-201ENSMUST00000200920 1249 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm46188-201ENSMUST00000219927 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Trim43b-201ENSMUST00000167113 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Xlr4b-202ENSMUST00000069103 1304 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm29427-201ENSMUST00000188520 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm22659-201ENSMUST00000104195 130 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm9051-201ENSMUST00000119335 1035 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms