Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Fgd1-202ENSMUST00000112685 3240 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Acot11-201ENSMUST00000065253 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Psat1-201ENSMUST00000025542 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Lhx6-204ENSMUST00000112966 3188 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm28557-203ENSMUST00000186303 3886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Atp4a-201ENSMUST00000005692 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Brip1os-202ENSMUST00000143819 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Trpm1-218ENSMUST00000206277 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Coro7-201ENSMUST00000038552 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gfpt1-201ENSMUST00000032057 2286 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Nolc1-209ENSMUST00000225780 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms