Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Eci2-201ENSMUST00000021854 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 5330439K02Rik-201ENSMUST00000180953 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2-Eb1P04230 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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H2-Eb1P04230 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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H2-Eb1P04230 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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H2-Eb1P04230 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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H2-Eb1P04230 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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H2-Eb1P04230 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Osbpl1a-204ENSMUST00000119043 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2-Eb1P04230 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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