Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Olfr804-202ENSMUST00000213331 5737 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Srp72F8VQC1 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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