Protein–RNA interactions for Protein: E9PVF1

Gm6904, Predicted gene 6904, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6904E9PVF1 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm6904E9PVF1 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gm6904E9PVF1 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms