Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn22Q9D7U6 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms