Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm24981-201ENSMUST00000104459 132 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm12420-201ENSMUST00000119869 1048 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm7190-201ENSMUST00000118669 1452 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm11497-201ENSMUST00000138295 2154 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 AC159006.3-201ENSMUST00000226918 664 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Atg3Q9CPX6 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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