Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp16Q99LG0 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Usp16Q99LG0 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Usp16Q99LG0 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp16Q99LG0 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp16Q99LG0 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp16Q99LG0 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp16Q99LG0 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms