Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cwc22Q8C5N3 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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