Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 AC153566.1-201ENSMUST00000216441 2057 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Grip1os1-201ENSMUST00000126965 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Airn-204ENSMUST00000160932 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Gm5960-201ENSMUST00000188483 406 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Smim4-201ENSMUST00000049732 311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ccdc18Q640L5 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc18Q640L5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ccdc18Q640L5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ccdc18Q640L5 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ccdc18Q640L5 Klk11-201ENSMUST00000080211 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm24597-201ENSMUST00000122503 300 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm5561-201ENSMUST00000178932 480 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Hbq1a-201ENSMUST00000020535 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 AC161763.1-201ENSMUST00000227063 168 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Chrne-202ENSMUST00000102556 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Cdadc1-202ENSMUST00000056997 2202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Tcl1-201ENSMUST00000041316 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc18Q640L5 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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