Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Padi3-202ENSMUST00000172098 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Sgo2b-201ENSMUST00000179944 3739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Rfx2-201ENSMUST00000002444 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Eftud2-212ENSMUST00000173679 2889 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Skap2Q3UND0 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms