Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Ighv8-6-201ENSMUST00000103524 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm12946-201ENSMUST00000122969 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp19Q3UJD6 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms