Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm15496-201ENSMUST00000129578 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Serpina3f-203ENSMUST00000167049 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm37873-201ENSMUST00000194571 2280 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm37052-201ENSMUST00000194929 1831 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
GscQ02591 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GscQ02591 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GscQ02591 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GscQ02591 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
GscQ02591 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Heatr4-201ENSMUST00000164935 3038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 B430010I23Rik-201ENSMUST00000123703 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 BC025920-202ENSMUST00000119492 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
GscQ02591 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Pklr-202ENSMUST00000107482 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Prn-202ENSMUST00000136783 3370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
GscQ02591 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.9 ms