Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Rad50-201ENSMUST00000020649 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Bckdk-207ENSMUST00000206745 1702 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Mcc-201ENSMUST00000089874 7858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Otx2P80206 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms