Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 A430046D13Rik-201ENSMUST00000180477 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Tmem255a-202ENSMUST00000089054 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Unc93a-201ENSMUST00000084966 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Ndrg1-201ENSMUST00000005256 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Usp10-202ENSMUST00000108988 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm38336-201ENSMUST00000193040 2549 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 F730016J06Rik-203ENSMUST00000156508 2593 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bp1P55194 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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