Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Harbi1-201ENSMUST00000090608 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm14663-201ENSMUST00000118474 1153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Snhg7os-201ENSMUST00000126798 546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm15280-201ENSMUST00000126961 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm5435-201ENSMUST00000179295 1150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm10522-201ENSMUST00000194503 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gzma-202ENSMUST00000224282 996 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Cphx3-201ENSMUST00000163305 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Cab39l-206ENSMUST00000225595 1380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Eef1d-218ENSMUST00000154584 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 2900052N01Rik-203ENSMUST00000191603 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Noxred1-203ENSMUST00000222480 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm45440-201ENSMUST00000209826 1655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Olfr271-ps1-201ENSMUST00000121614 952 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 E330010L02Rik-201ENSMUST00000136639 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm29323-201ENSMUST00000189792 332 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm44778-201ENSMUST00000206447 668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Olfr271-ps1-202ENSMUST00000217546 852 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm14267-205ENSMUST00000226697 1299 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 2700029L08Rik-201ENSMUST00000202895 1465 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gpatch4-202ENSMUST00000166021 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Pla2g2d-202ENSMUST00000105806 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm15416-201ENSMUST00000131080 442 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Tcl1b2-202ENSMUST00000142230 851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm9844-201ENSMUST00000170837 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Zfp493-203ENSMUST00000181319 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm3473-201ENSMUST00000216911 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 AC125350.3-202ENSMUST00000224295 457 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 AC154283.2-201ENSMUST00000228954 614 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Ctla4-201ENSMUST00000027164 1933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Snx7-205ENSMUST00000198499 1314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 AC135083.1-201ENSMUST00000227773 1331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Sertad4-201ENSMUST00000016406 3090 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm14735-201ENSMUST00000121772 3088 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Rita1-202ENSMUST00000111884 733 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Zfx-202ENSMUST00000113925 879 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Mif-ps3-201ENSMUST00000118636 345 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm12508-201ENSMUST00000121282 480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm13056-201ENSMUST00000142429 564 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1P40201 n-R5s210-201ENSMUST00000177688 119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm44744-201ENSMUST00000208234 852 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm18029-201ENSMUST00000219973 844 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chd1P40201 Gm10398-201ENSMUST00000100826 397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 E330017L17Rik-202ENSMUST00000139190 861 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 1700019N19Rik-202ENSMUST00000166692 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chd1P40201 Gm14147-202ENSMUST00000178211 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms