Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Itsn1-204ENSMUST00000113993 3787 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Tmem252-201ENSMUST00000057243 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Cd28P31041 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Sypl-202ENSMUST00000076698 4999 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 2310043P16Rik-201ENSMUST00000205403 3881 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Ralgps1-204ENSMUST00000113165 6192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Rabgef1-201ENSMUST00000026390 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gpr75-201ENSMUST00000109430 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Klrc2-202ENSMUST00000112057 1149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Pkp1-203ENSMUST00000163260 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Rbm10-203ENSMUST00000084383 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Cd28P31041 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
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