Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Zfr-201ENSMUST00000122941 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ggta1P23336 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms