Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm42811-201ENSMUST00000201951 2768 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Synj2-209ENSMUST00000115790 4808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Tpmt-201ENSMUST00000021806 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Tbx19-201ENSMUST00000027859 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Adar-202ENSMUST00000098924 5909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Eif2b3-201ENSMUST00000070610 1369 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Cntrl-212ENSMUST00000156933 7189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm7933-201ENSMUST00000191215 2255 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Pwp1-201ENSMUST00000001836 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Hdac7-206ENSMUST00000119670 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Emc1-205ENSMUST00000179784 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Wdfy3-207ENSMUST00000212024 10539 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Evc-203ENSMUST00000114154 3695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Lpar1-202ENSMUST00000107570 3244 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Bcl6b-201ENSMUST00000000326 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm18981-201ENSMUST00000185373 1599 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Vpreb1P13372 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms