Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Gm2035J3QP87 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms