Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf169E9Q7F2 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms