Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 AC122858.2-201ENSMUST00000228571 1362 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Eef1d-218ENSMUST00000154584 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Ccdc141-203ENSMUST00000111833 631 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Dnmt3l-ps1-201ENSMUST00000118734 1253 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm17084-201ENSMUST00000163843 511 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 2410021H03Rik-201ENSMUST00000187090 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Rp1-202ENSMUST00000194992 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm32858-201ENSMUST00000205246 585 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm16252-202ENSMUST00000215604 1232 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Rnase11-201ENSMUST00000076106 713 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Mir195a-201ENSMUST00000083477 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Rgs6-201ENSMUST00000101234 1368 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Poteg-201ENSMUST00000081321 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Map2k7-204ENSMUST00000110995 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 1700013D24Rik-201ENSMUST00000112537 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm12133-201ENSMUST00000121775 661 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm20529-201ENSMUST00000173683 203 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm30873-201ENSMUST00000207512 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 AC139130.1-201ENSMUST00000228281 620 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Defa21-201ENSMUST00000076754 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Defa22-201ENSMUST00000098897 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Olfr1229-201ENSMUST00000099788 1019 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm20501-202ENSMUST00000211303 2194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 2900052N01Rik-203ENSMUST00000191603 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Pdcd1lg2-201ENSMUST00000112576 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Rab3b-203ENSMUST00000106651 1078 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gimap4-203ENSMUST00000118802 771 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm5776-201ENSMUST00000122119 321 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm13564-201ENSMUST00000131533 657 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm21370-201ENSMUST00000177659 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm21188-201ENSMUST00000178618 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Ly6c1-205ENSMUST00000187347 522 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Rpl21-ps12-201ENSMUST00000080061 480 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 2310034C09Rik-201ENSMUST00000089111 946 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm4795-201ENSMUST00000095717 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm14147-202ENSMUST00000178211 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NhsB1AV60 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms