Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lcn6A2AJB9 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Lcn6A2AJB9 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Lcn6A2AJB9 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Lcn6A2AJB9 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Lcn6A2AJB9 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Lcn6A2AJB9 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms