Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Zfp532-201ENSMUST00000049016 5503 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Frmd6-201ENSMUST00000057859 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Cenpo-202ENSMUST00000111169 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Ep400-210ENSMUST00000146458 3673 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Arid1a-201ENSMUST00000008024 6486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Use1Q9CQ56 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Frmpd1-201ENSMUST00000044773 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Use1Q9CQ56 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms