Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ciao1Q99KN2 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ciao1Q99KN2 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ciao1Q99KN2 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ciao1Q99KN2 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ciao1Q99KN2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ciao1Q99KN2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ciao1Q99KN2 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ciao1Q99KN2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ciao1Q99KN2 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ciao1Q99KN2 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ciao1Q99KN2 Gm22994-201ENSMUST00000175422 82 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm7583-201ENSMUST00000182941 1005 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ciao1Q99KN2 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms