Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Tgm7-201ENSMUST00000110675 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Dpy19l2-201ENSMUST00000133010 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Slc35f6-201ENSMUST00000062962 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Far1-211ENSMUST00000164745 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Eif3c-201ENSMUST00000032992 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Gm44926-201ENSMUST00000207898 1826 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pacsin3Q99JB8 Sms-201ENSMUST00000112529 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms