Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 CN725425-201ENSMUST00000109284 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Efna1-201ENSMUST00000029566 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Fcgr3-204ENSMUST00000169017 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ttc21aQ8C0S4 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Guca2b-202ENSMUST00000106309 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc21aQ8C0S4 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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