Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Serpina3m-202ENSMUST00000168797 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Myl6-201ENSMUST00000164181 665 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm30074-201ENSMUST00000193192 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 2810029C07Rik-201ENSMUST00000180698 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Zfp462-201ENSMUST00000030131 4823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm14326-203ENSMUST00000108932 888 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 Gm7594-201ENSMUST00000218595 871 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Atg16l1Q8C0J2 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms