Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm21247-201ENSMUST00000189954 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21869-201ENSMUST00000189976 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21787-201ENSMUST00000189993 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21658-201ENSMUST00000190025 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21804-201ENSMUST00000190072 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20868-201ENSMUST00000190110 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21573-201ENSMUST00000190112 691 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21843-201ENSMUST00000190137 694 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20841-201ENSMUST00000190209 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21918-201ENSMUST00000190310 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm29279-201ENSMUST00000190324 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20934-201ENSMUST00000190359 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21868-202ENSMUST00000190370 694 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21805-201ENSMUST00000190371 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20818-201ENSMUST00000190372 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21740-201ENSMUST00000190382 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21155-201ENSMUST00000190460 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21245-201ENSMUST00000190467 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21242-201ENSMUST00000190489 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21530-201ENSMUST00000190506 694 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20904-201ENSMUST00000190518 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21802-201ENSMUST00000190593 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21799-201ENSMUST00000190662 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21835-201ENSMUST00000190671 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21851-201ENSMUST00000190752 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20892-201ENSMUST00000190755 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21634-201ENSMUST00000190775 694 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21506-201ENSMUST00000190786 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21201-201ENSMUST00000190814 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20848-201ENSMUST00000190836 678 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20860-201ENSMUST00000190842 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21838-201ENSMUST00000190955 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm29267-201ENSMUST00000191020 378 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20882-201ENSMUST00000191028 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20798-201ENSMUST00000191050 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm28107-201ENSMUST00000191118 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21875-201ENSMUST00000191195 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21285-201ENSMUST00000191214 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21908-201ENSMUST00000191224 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21924-201ENSMUST00000191308 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm28459-201ENSMUST00000191319 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21316-201ENSMUST00000191348 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20893-201ENSMUST00000191376 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21287-201ENSMUST00000191377 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21790-201ENSMUST00000191392 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20808-201ENSMUST00000191433 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21114-201ENSMUST00000191466 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21872-201ENSMUST00000191488 678 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21755-201ENSMUST00000191507 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21151-201ENSMUST00000191536 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20862-201ENSMUST00000191559 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20891-201ENSMUST00000191560 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21774-201ENSMUST00000191592 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21076-201ENSMUST00000191597 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21672-201ENSMUST00000191609 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21791-201ENSMUST00000191631 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm31186-201ENSMUST00000191786 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21065-201ENSMUST00000191793 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21845-201ENSMUST00000191848 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20840-201ENSMUST00000192165 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21469-201ENSMUST00000193164 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21427-201ENSMUST00000193270 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm35955-201ENSMUST00000193437 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm31335-201ENSMUST00000193949 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm20925-201ENSMUST00000193967 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm33112-201ENSMUST00000193971 699 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21661-201ENSMUST00000194101 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21412-201ENSMUST00000194618 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm38016-201ENSMUST00000194806 693 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21763-201ENSMUST00000195140 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21890-201ENSMUST00000195190 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm21350-201ENSMUST00000195678 696 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 1810009J06Rik-201ENSMUST00000076638 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm15423-201ENSMUST00000150600 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm15353-201ENSMUST00000110860 702 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm12619-201ENSMUST00000117369 385 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm14828-201ENSMUST00000119381 1155 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm6665-201ENSMUST00000165131 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm9866-201ENSMUST00000177636 486 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp54Q8BL06 Gm5652-201ENSMUST00000182336 1008 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms