Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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BcanQ61361 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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BcanQ61361 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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BcanQ61361 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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BcanQ61361 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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BcanQ61361 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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BcanQ61361 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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BcanQ61361 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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BcanQ61361 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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BcanQ61361 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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BcanQ61361 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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BcanQ61361 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
BcanQ61361 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms