Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Pde1c-204ENSMUST00000164752 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm12059-201ENSMUST00000128996 3105 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm26704-201ENSMUST00000181362 2901 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm35394-201ENSMUST00000196434 3252 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Baiap3-201ENSMUST00000169109 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm12381-201ENSMUST00000126314 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Skap2Q3UND0 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms