Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Usp19Q3UJD6 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp19Q3UJD6 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms