Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm15947-201ENSMUST00000161395 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gpr68-203ENSMUST00000110066 3223 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Dlgap4-202ENSMUST00000070782 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Fgd1-202ENSMUST00000112685 3240 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
GscQ02591 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 4933427D06Rik-204ENSMUST00000168837 2467 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Ftsj3-201ENSMUST00000021048 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
GscQ02591 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Plekhb2-201ENSMUST00000027297 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Pkd2l2-202ENSMUST00000166156 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
GscQ02591 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms