Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm37516-201ENSMUST00000192593 1954 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Pde1bQ01065 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms