Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Nmb-201ENSMUST00000026817 705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm11771-201ENSMUST00000118124 732 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm26978-201ENSMUST00000182843 304 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm26440-201ENSMUST00000082591 129 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Baat-201ENSMUST00000043056 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
Lmo4P61969 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Lmo4P61969 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Lmo4P61969 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Lmo4P61969 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Lmo4P61969 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Lmo4P61969 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Lmo4P61969 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Lmo4P61969 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Lmo4P61969 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Lmo4P61969 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms