Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm42067-202ENSMUST00000210917 410 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 AC155293.1-201ENSMUST00000219793 1026 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Pln-205ENSMUST00000219921 531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 AC116589.8-201ENSMUST00000220945 364 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 AC116390.1-201ENSMUST00000227975 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm8016-201ENSMUST00000221830 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Tmem254c-201ENSMUST00000100818 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Olfr281-201ENSMUST00000109163 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm15208-201ENSMUST00000134448 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm11959-201ENSMUST00000148655 723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 CT025603.2-201ENSMUST00000224369 484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 AC139845.1-201ENSMUST00000147013 1334 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm36948-201ENSMUST00000194708 3247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm12168-201ENSMUST00000119051 368 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm4996-201ENSMUST00000122042 784 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm15727-201ENSMUST00000122416 437 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm11947-201ENSMUST00000125275 273 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 A730090N16Rik-201ENSMUST00000160137 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm26679-201ENSMUST00000181685 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm3534-201ENSMUST00000182522 1001 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 AC157931.1-201ENSMUST00000198565 346 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Cyp2e1-203ENSMUST00000210235 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 AU015228-201ENSMUST00000121103 1320 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Mcph1-205ENSMUST00000146819 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm14239-201ENSMUST00000116491 685 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm14834-201ENSMUST00000119416 795 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cux1P53564 Gm12415-201ENSMUST00000141637 512 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms